隨著氣相色譜分析的發展，毛細柱的應用越來越廣泛。毛細柱在內部涂漬一層極薄而又均勻的固定液膜，解決了組分在填充柱中由于受到大小不均勻載體顆粒的阻礙而造成的色譜峰擴展、柱效低等問題。由于毛細柱具有相比大、滲透性好、分析速度快、總柱效高等優點，可以解決填充柱不能解決或者很難解決的問題，大大提高了氣相色譜法對復雜物質的分離能力。

　　相對于填充柱而言，毛細柱其優點體現在：

　　1.滲透性好，可使用長色譜柱

　　對于毛細柱而言，其柱滲透性好，即載氣流動阻力小。毛細柱的比滲透率約為填充柱的100倍，這樣就可能在同樣的壓降下，使用100m以上的柱子，而載氣的線速度可保持不變。

　　2.相比（β）大，有利于實現快速分析

　　根絕塔板理論，相比（β）大（固定相液膜厚度小），有利于提高柱效；同時由于毛細柱滲透性好，可以使用很高的載氣流速，實現快速分析。

　　3.總柱效高，分離復雜混合物的能力大為提高

　　從單位柱長的柱效來看，毛細柱的柱效優于填充柱，但是二者仍處于同一數量級，但是毛細柱的長度（10m-100m）比填充柱的長度（1m-10m）大1-2個數量級，所以毛細柱的總柱效是遠高于填充柱的，因此可以解決復雜混合物的分離分析問題。